Provinsi Maluku Utara hingga saat ini memiliki 13 buah pelabuhan udara yang terdiri dari Kelas III 1 buah, Kelas IV 2 buah, Kelas V 3 buah dan Kelas Perintis 6 buah. Bandara udara di Provinsi Maluku Utara berlokasi di:
1. Bandara Gamarlamo
Lokasi : Galela (Pulau Halmahera)
Kelas : IV
Ukuran (Runaway) : 850 x 3
Kapasitas : DHC6/C 212
2. Bandara Kuabang
Lokasi : Kao (Pulau Halmahera)
Kelas : IV
Ukuran (Runaway) : 700 x 23
Kapasitas : DHC6/C 212
|
5. Bandara Pitu
Lokasi : Morotai Selatan
Kelas : ---
Ukuran (Runaway) : 850 x 23
Kapasitas : F 27
|
|
3. Bandara Lily
Lokasi : Tobelo (P. Halmahera)
Kelas : Perintis
Ukuran (Runaway) : 2.440 x 45
Kapasitas : PA 23
|
7. Bandara Emalamo
Lokasi : Sanana (P. Sulawesi)
Kelas : Perintis
Ukuran (Runaway) : 1.100 x 30
Kapasitas : DHC6/C 212
|
|
4. Bandara Usman Sadik
Lokasi : Labuha (P. Bacan)
Kelas : V
Ukuran (Runaway) : 850 x 23
Kapasitas : DHC6/C 212
|
9. Bandara Bobong
Lokasi : P. Taliabu Barat
Kelas : ---
Ukuran (Runaway) : 650 x 25
Kapasitas : belum digunakan/rusak
|
|
6. Bandara Falabisahaya
Lokasi : P. Mangoli
Kelas : V
Ukuran (Runaway) : 1.050 x 18
Kapasitas : DHC6/C 212
|
11. Bandara Gebe
Lokasi : Pulau Gebe
Kelas : Perintis
Ukuran (Runaway): 960 x 23
Kapasitas : DHC6/C 212
|
|
8. Bandara Wai Mina
Lokasi : P. Taliabu
Kelas : Perintis
Ukuran (Runaway) : 900 x 20
Kapasitas : PA 23
|
13. Bandara Babullah
Lokasi : Pulau Ternate
Kelas : III
Ukuran (Runaway): 1.420 x 30
Kapasitas : F27
|
|
10. Bandara Kuri Pasai
Lokasi : Ake Diri (P. Halmahera)
Kelas : Perintis
Ukuran (Runaway) : ---
Kapasitas : ---
12. Bandara Buli
Lokasi : Buli (P. Halmahera)
Kelas : Perintis
Ukuran (Runaway) : 900 x 23
Kapasitas : DHC6/C 212
Maskapai penerbangan yang beroperasi di Provinsi Maluku Utara antara lain Merpati Nusantara Airlines, Lion Air, Wings Air dan Express Air, Batavia Air dengan 6 (enam) rute penerbangan yaitu :
1. Ternate - Manado - Surabaya - Jakarta
2. Ternate - Makassar - Jakarta
3. Ternate - Makassar - Bali
4. Ternate - Ambon
5. Ternate - Sorong
6. Ternate - Jakarta - Surabaya